MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187078	TAT	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249100
2	NT_187078	TCG	2	6	1270	1275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249100
3	NT_187078	CA	3	6	1341	1346	50 %	0 %	0 %	50 %	409249100
4	NT_187078	CGC	2	6	1363	1368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249100
5	NT_187078	TCG	2	6	1445	1450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249100
6	NT_187078	CCG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249100
7	NT_187078	GCG	2	6	1469	1474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249100
8	NT_187078	GGT	2	6	1477	1482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249100
9	NT_187078	AATG	2	8	1537	1544	50 %	25 %	25 %	0 %	409249100
10	NT_187078	TAT	2	6	1603	1608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249100
11	NT_187078	GCT	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249100
12	NT_187078	TGA	2	6	1719	1724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249100
13	NT_187078	ATG	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249100
14	NT_187078	AGG	2	6	1832	1837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249100
15	NT_187078	CCA	2	6	1882	1887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249101
16	NT_187078	GCT	2	6	1922	1927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249101
17	NT_187078	GGT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249101
18	NT_187078	GA	3	6	2068	2073	50 %	0 %	50 %	0 %	409249101
19	NT_187078	GC	3	6	2178	2183	0 %	0 %	50 %	50 %	409249101
20	NT_187078	GAG	2	6	2283	2288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249101
21	NT_187078	CCG	2	6	2370	2375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249101
22	NT_187078	ATG	2	6	2404	2409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249101
23	NT_187078	CT	3	6	2437	2442	0 %	50 %	0 %	50 %	409249101
24	NT_187078	GCT	2	6	2552	2557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249101
25	NT_187078	TTA	2	6	2609	2614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249101
26	NT_187078	CTG	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249101
27	NT_187078	GTG	2	6	2678	2683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249101
28	NT_187078	TGC	2	6	2716	2721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249101
29	NT_187078	GCC	2	6	2728	2733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249101
30	NT_187078	GCT	2	6	2756	2761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249101
31	NT_187078	GCT	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249101
32	NT_187078	GCG	2	6	2872	2877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249101
33	NT_187078	CGC	2	6	2884	2889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249101
34	NT_187078	GCG	2	6	2909	2914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249101
35	NT_187078	TGAG	2	8	2938	2945	25 %	25 %	50 %	0 %	409249101
36	NT_187078	TGT	2	6	2971	2976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249101
37	NT_187078	GAG	2	6	3006	3011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249101
38	NT_187078	GGGC	2	8	3102	3109	0 %	0 %	75 %	25 %	409249101
39	NT_187078	GAC	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249101
40	NT_187078	GGA	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249101
41	NT_187078	GGC	3	9	3195	3203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249101
42	NT_187078	GAT	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249101
43	NT_187078	TATT	2	8	3235	3242	25 %	75 %	0 %	0 %	409249101
44	NT_187078	GAA	2	6	3302	3307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249102
45	NT_187078	AC	3	6	3410	3415	50 %	0 %	0 %	50 %	409249102
46	NT_187078	TC	3	6	3421	3426	0 %	50 %	0 %	50 %	409249102
47	NT_187078	GACG	2	8	3481	3488	25 %	0 %	50 %	25 %	409249102
48	NT_187078	TTG	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249102
49	NT_187078	TGC	2	6	3623	3628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249102
50	NT_187078	GGC	2	6	3635	3640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249102
51	NT_187078	ACG	2	6	3765	3770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249102
52	NT_187078	GCC	2	6	3788	3793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249102
53	NT_187078	ACG	2	6	3864	3869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249102
54	NT_187078	GC	3	6	3876	3881	0 %	0 %	50 %	50 %	409249102
55	NT_187078	AG	3	6	3910	3915	50 %	0 %	50 %	0 %	409249102
56	NT_187078	TTA	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249102
57	NT_187078	AAC	2	6	3951	3956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249102
58	NT_187078	CAC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249103
59	NT_187078	GAA	2	6	4132	4137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249103
60	NT_187078	GCA	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249103
61	NT_187078	GCC	2	6	4150	4155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249103
62	NT_187078	CGA	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249103
63	NT_187078	TGG	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249103
64	NT_187078	GATA	2	8	4308	4315	50 %	25 %	25 %	0 %	409249103
65	NT_187078	TTG	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249103
66	NT_187078	GAT	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249103
67	NT_187078	TTG	2	6	4514	4519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249103
68	NT_187078	T	6	6	4543	4548	0 %	100 %	0 %	0 %	409249103
69	NT_187078	GAT	2	6	4627	4632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249103
70	NT_187078	TCG	2	6	4707	4712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249103
71	NT_187078	GAC	2	6	4846	4851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249103
72	NT_187078	GCTGG	2	10	4857	4866	0 %	20 %	60 %	20 %	409249103
73	NT_187078	GCC	2	6	4868	4873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249103
74	NT_187078	TTC	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249103
75	NT_187078	GC	3	6	4918	4923	0 %	0 %	50 %	50 %	409249103
76	NT_187078	TGG	2	6	4928	4933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249103
77	NT_187078	GC	4	8	4958	4965	0 %	0 %	50 %	50 %	409249103
78	NT_187078	TTG	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249103
79	NT_187078	CGC	2	6	5105	5110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249103
80	NT_187078	CGG	2	6	5129	5134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249103
81	NT_187078	GGT	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249103
82	NT_187078	T	6	6	5173	5178	0 %	100 %	0 %	0 %	409249103
83	NT_187078	CTG	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249103
84	NT_187078	GGA	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249103
85	NT_187078	GGC	2	6	5313	5318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249103
86	NT_187078	A	6	6	5323	5328	100 %	0 %	0 %	0 %	409249103
87	NT_187078	TCT	2	6	5332	5337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249103
88	NT_187078	TGA	2	6	5381	5386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249103
89	NT_187078	TTC	2	6	5440	5445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249103
90	NT_187078	T	6	6	5448	5453	0 %	100 %	0 %	0 %	409249103
91	NT_187078	CAT	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249104
92	NT_187078	CAG	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249104
93	NT_187078	CGC	2	6	5566	5571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249104
94	NT_187078	TAA	2	6	5583	5588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249104
95	NT_187078	CG	3	6	5620	5625	0 %	0 %	50 %	50 %	409249104
96	NT_187078	CTC	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249104
97	NT_187078	TGC	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249104
98	NT_187078	GTC	2	6	5732	5737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249104
99	NT_187078	TGA	2	6	5757	5762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249104
100	NT_187078	CAG	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249104
101	NT_187078	CAG	2	6	5806	5811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249104
102	NT_187078	ATT	2	6	5899	5904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249104
103	NT_187078	TGG	2	6	5967	5972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249104
104	NT_187078	GGT	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249104
105	NT_187078	ATG	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249104
106	NT_187078	GGC	2	6	6130	6135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249104
107	NT_187078	GCG	2	6	6143	6148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249104
108	NT_187078	CGC	2	6	6243	6248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249104
109	NT_187078	GC	4	8	6384	6391	0 %	0 %	50 %	50 %	409249104
110	NT_187078	TCA	2	6	6521	6526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249104
111	NT_187078	CGC	2	6	6549	6554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249104
112	NT_187078	GCGTA	2	10	6597	6606	20 %	20 %	40 %	20 %	409249104
113	NT_187078	C	6	6	6635	6640	0 %	0 %	0 %	100 %	409249104
114	NT_187078	TGC	2	6	6668	6673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249104
115	NT_187078	GCC	3	9	6695	6703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249104
116	NT_187078	GCT	2	6	6771	6776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249104
117	NT_187078	ACG	2	6	6806	6811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249104
118	NT_187078	GCT	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249104
119	NT_187078	TCT	2	6	6845	6850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249104
120	NT_187078	AGCG	2	8	6854	6861	25 %	0 %	50 %	25 %	409249104
121	NT_187078	CCA	2	6	6999	7004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249104
122	NT_187078	ATGG	2	8	7034	7041	25 %	25 %	50 %	0 %	409249104
123	NT_187078	TTA	2	6	7061	7066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249104
124	NT_187078	GTG	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249104
125	NT_187078	TCA	2	6	7289	7294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249105
126	NT_187078	A	6	6	7313	7318	100 %	0 %	0 %	0 %	409249105
127	NT_187078	GCGT	2	8	7332	7339	0 %	25 %	50 %	25 %	409249105
128	NT_187078	AAACG	2	10	7352	7361	60 %	0 %	20 %	20 %	409249105
129	NT_187078	ATCA	2	8	7414	7421	50 %	25 %	0 %	25 %	409249105
130	NT_187078	GC	3	6	7446	7451	0 %	0 %	50 %	50 %	409249105
131	NT_187078	CGG	2	6	7461	7466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249105
132	NT_187078	AAT	2	6	7537	7542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249105
133	NT_187078	AGTAA	2	10	7633	7642	60 %	20 %	20 %	0 %	409249105
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263	NT_187078	CAGC	2	8	14131	14138	25 %	0 %	25 %	50 %	409249111
264	NT_187078	CAT	2	6	14186	14191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249111
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266	NT_187078	GCG	2	6	14337	14342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249111
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280	NT_187078	CCG	2	6	14896	14901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249112
281	NT_187078	CTT	2	6	14912	14917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249112
282	NT_187078	CGT	2	6	14942	14947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249112
283	NT_187078	GC	3	6	14969	14974	0 %	0 %	50 %	50 %	409249112
284	NT_187078	GGC	2	6	14990	14995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249112
285	NT_187078	TCT	2	6	15019	15024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249112
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294	NT_187078	A	7	7	15560	15566	100 %	0 %	0 %	0 %	409249112
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362	NT_187078	T	6	6	18909	18914	0 %	100 %	0 %	0 %	409249115
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379	NT_187078	GCCA	2	8	20039	20046	25 %	0 %	25 %	50 %	409249116
380	NT_187078	ATG	2	6	20093	20098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249116
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385	NT_187078	CATC	2	8	20956	20963	25 %	25 %	0 %	50 %	409249117
386	NT_187078	GAA	2	6	21000	21005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249117
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388	NT_187078	GCC	2	6	21020	21025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249117
389	NT_187078	CCG	2	6	21037	21042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249117
390	NT_187078	GAC	2	6	21099	21104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249117
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392	NT_187078	GTT	2	6	21142	21147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249117
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394	NT_187078	ACGCC	2	10	21230	21239	20 %	0 %	20 %	60 %	409249117
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499	NT_187078	ACGGC	2	10	27896	27905	20 %	0 %	40 %	40 %	409249122
500	NT_187078	CTT	2	6	27924	27929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249122

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